জাতীয়করণের লক্ষ্যে প্রধানমন্ত্রীর সম্মতিপ্রাপ্ত ও তালিকাভুক্ত তিনটি স্কুল বাদ পড়ছে। প্রধানমন্ত্রীর অফিস থেকে ১১ অক্টোবর পাঠানো একটি চিঠি শিক্ষা বিষয়ক দেশের একমাত্র অনলাইন জাতীয় পত্রিকা দৈনিকশিক্ষার হাতে পৌঁছেছে। চিঠির বিষয় বিদ্যালয় জাতীয়করণে সম্মতি পরিবর্তন সংক্রান্ত।
প্রধানমন্ত্রীর একান্ত সচিব-১ সাজ্জাদুল হাসান স্বাক্ষরিত চিঠিটি মাধ্যমিক ও উচ্চশিক্ষা বিভাগের সচিব মো: সোহরাব হোসাইনের কাছে পাঠানো হয়েছে। চিঠিতে প্রধানমন্ত্রীর কাযালয়ের গত ২৪ আগস্টের একটি চিঠির বরাত দিয়ে বলা হয়েছে, সংযুক্ত তালিকার ১২১ নং ক্রমিকে বর্ণিত পঞ্চগড় জেলাধীন বোদা উপজেলার ‘বোদা পাইলট গার্লস স্কুল এন্ড কলেজ জাতীয়করণের সম্মতি অনিবায কারণে এতদ্বারা বাতিল করা হলো।
বাতিলের তালিকায় থাকা অপর দুই স্কুল হচ্ছে চট্টগ্রামের বোয়ালখালী উপজেলার গোমদণ্ডী পাইলট মডেল উচ্চ বিদ্যালয় ও ভোলা জেলার মনপুরা মাধ্যমিক বিদ্যালয়।