বঙ্গবন্ধু শেখ মুজিব মেডিক্যাল বিশ্ববিদ্যালয়ে বর্তমানে ৫১টি বিভাগ চালু রয়েছে। বিশ্ববিদ্যালয়টিতে নতুন করে আরো ছয়টি বিভাগ ও সাতটি ডিভিশন চালু হচ্ছে।
ইনস্টিটিউট অব প্যাডিয়াট্রিক নিউরোডিস-অর্ডার অ্যান্ড অটিজমকে (ইপনা) ইনস্টিটিউট হিসেবে অনুমোদনসহ হেড-নেক সার্জারিতে ফেলোশিপ ইন হেড-নেক সার্জারির অনুমোদন দেওয়া হয়েছে। গতকাল বিশ্ববিদ্যালয়ের উপাচার্য অধ্যাপক ডা. কামরুল হাসান খানের সভাপতিত্বে অনুষ্ঠিত একাডেমিক কাউন্সিলের সভায় এই অনুমোদন দেওয়া হয়।
সভায় অন্যদের মধ্যে উপস্থিত ছিলেন উপ-উপাচার্য অধ্যাপক ডা. মো. শহীদুল্লাহ সিকদার, অধ্যাপক ডা. মো. শারফুদ্দিন আহমেদ, অধ্যাপক ডা. এস এম জাকারিয়া স্বপন, কোষাধ্যক্ষ অধ্যাপক ডা. মোহাম্মদ আলী আসগর মোড়ল, মেডিসিন অনুষদের ডিন অধ্যাপক ডা. এ বি এম আবদুল্লাহ, বেসিক সায়েন্স ও প্যারাক্লিনিক্যাল সায়েন্স অনুষদের ডিন অধ্যাপক ডা. এম ইকবাল আর্সলান, ডেন্টাল অনুষদের ডিন অধ্যাপক ডা. গাজী শামীম হাসান প্রমুখ।
অনুমোদিত নতুন বিভাগগুলো হলো অবস অ্যান্ড গাইনি বিভাগের অধীনে পরিচালিত রিপ্রডাক্টিভ এন্ডোক্রাইনোলজি অ্যান্ড ইনফারটিলিটি, গাইনোকোলজিক্যাল অনকোলজি, ফিটো-মেটারনাল মেডিসিন; সার্জারি বিভাগের অধীন হেপাটোবিলিয়ারি, প্যানক্রিয়েটিক অ্যান্ড লিভার ট্রান্সপ্লান্ট সার্জারি, কলোরেক্টাল সার্জারি এবং সার্জিক্যাল অনকোলজি। এ ছাড়া সার্জারি বিভাগের অধীনে একটি মিনিমাল ইনভেসিভ সার্জারি সেন্টারের অনুমোদন দেওয়া হয়। অনুমোদিত নতুন ডিভিশনগুলো হলো শিশু সার্জারি বিভাগের অধীন পেডিয়াট্রিক ইউরোলজি, পেডিয়াট্রিক সার্জিক্যাল অনকোলজি, নিউনেটাল সার্জারি; রেজিওলজি অ্যান্ড ইমেজিং বিভাগের অধীন নিউরোরেডিওলজি, ইন্টারভেনশনাল রেডিওলজি, প্যাডিয়াট্রিক রেডিওলজি ও মাস্কুলোস্কেলেটাল রেডিওলজি।