জগন্নাথ বিশ্ববিদ্যালয়ে প্রতি পাঁচজনে শিক্ষকের বিপরীতে একজন শিক্ষক রয়েছেন উচ্চশিক্ষার ছুটিতে। ইউজিসির সর্বশেষ প্রতিবেদন অনুযায়ী বিশ্ববিদ্যালয়টিতে মোট শিক্ষক সংখ্যা ৬৭৮ জন। যার মধ্যে ১২৬ জন শিক্ষকই উচ্চশিক্ষার ছুটিতে রয়েছে।
শিক্ষক সংকট ও কর্মরত শিক্ষকদের ছুটিতে থাকায় অনেক বিভাগেই এ সংকট তীব্রভাবে দেখা দিয়েছে। ইউজিসির সর্বশেষ প্রতিবেদন বলছে জবিতে কর্তব্যরত শিক্ষক সংখ্যা ৫৩৯ জন, শিক্ষাছুটিতে রয়েছে ১২৬ জন, প্রেষণে রয়েছেন ২ জন শিক্ষক। এছাড়াও বিনাবেতনে ১ জন, অননুমোদিত ৭ জন ও চুক্তিভিত্তিক শিক্ষক রয়েছেন ৩ জন।
আন্তর্জাতিকভাবে উচ্চ শিক্ষাপ্রতিষ্ঠানে শিক্ষক-শিক্ষার্থীর গড় অনুপাতের নূন্যতম মানদণ্ড ধরা হয় ১:২০। অর্থাৎ প্রতি ২০ জন শিক্ষার্থীর জন্য একজন করে শিক্ষক। তবে, জবিতে মোট ১৫ হাজার ৯৬০জন শিক্ষার্থীর বিপরীতে শিক্ষক রয়েছে ৬৭৮ জন। এ পরিসংখ্যান অনুযায়ী বিশ্ববিদ্যালয়টিতে প্রতি ২৪ জন শিক্ষার্থীর বিপরীতে রয়েছেন একজন শিক্ষক। অপরদিকে মোট শিক্ষার্থীর বিপরীতে কর্তব্যরত শিক্ষকের অনুপাতে হিসাব করলে সংখ্যাটি দাঁড়ায় প্রায় ৩০ জন শিক্ষার্থীর বিপরীতে একজন কর্মরত শিক্ষক রয়েছে।
